נולד בשנת ש' לערך לאביו ר' ישראל. עבר לפרעמישלא משנשא את בתו של ר' יהושע אבי משפחת שמלקיס, בנו של הגביר חותן המהר"ל ר' שמואל שמלקא מפרג שלעושרו נקרא "רייך", ב"ר יעקב מפרג. אחרי פטירתה נשא את מרים בילא אחות הרמ"א, נפטרה י"ח אלול שע"ז (ולא של"ז), בת ר' ישראל איסרס (נפטר י"ג אד"א שכ"ח), ב"ר יוסף מקראקא. עבר לקראקא, והיה פרנס וד"א ומנהיג המדינה. כששהה שם רבי ישראל סרוק מגורי הארי"י, העיד עליו שנשמתו היא נשמת רבי פנחס בן יאיר. נפטר בשבת ט"ז טבת שע"ח, ונטמן למחרת. הניח ספר על הטור.
בית פנחס, חלק אחד מספר הפלאה, על מסכתות יבמות ומכות, פיעטרקוב, ר' אברהם יוסף בן חוה ליפטשא פישער מאלכסנדר, דפוס ר' מרדכי צעדערבוים, תרס"ט, ב, מח; י' ד', וד"ץ בני־ברק תשכ"ח. המסכימים: האבני נזר באוטוצק (אישר שהחידושים מכתב ידו של המחבר, ואין צורך בהסכמות); ר' שמואל וייס אב"ד ונגרוב בפקודת האבני נזר; ר' יוסף לוינשטין מסרוצק נכד המחבר (נתן למו"ל את כת"י הספר שנשלם בכ"ט אלול ער"ה ש"ע, והיה אצלו ממורשת אבותיו); ר' ישראל לנדא אב"ד סדיגורה. בהקדמת המלבה"ד רשימת הספרים שהוציא לאור, והבעת תקוה שיוציא לאור גם ח"ב, ועוד ספרים שביניהם מטעמי יצחק ולחם מצ"ה מר' איציקל מאה"ו ובנו ר' מרדכי צבי, ושו"ת לחם מצ"ה מהבן. הנכד ר"י לוינשטין שאצלו היו הכתבים השתוקק להדפיסם. למטרה זו שלח את הפנקס עמ"ס מכות בכורות וערכין לש"ב ר' ישראל לנדא מסדיגורה, ושני פנקסים של יבמות וב"ק, תולדות המחבר והגהות הלבוש על הש"ס, לש"ב ר' אלעזר ליפשיץ באלכסנדר נכד המחבר. בגלל הכתב הישן היה קשה למקבלים להעתיקם, ולכן כתב ר"י לוינשטין אל המו"ל שמוכן לתתם לו במתנה גמורה, אם יטפל בהעתקתם ובהוצאתם לאור. כשרא"י פישר הביע את הסכמתו, נשלחו אליו הפנקסים משני המקומות. סייעו לו בהעתקה ר' חנוך הניך חתן ר' אברהם יעקב משב"ק באלכסנדר נכד היהודי הקדוש, ור' משה בריש מאלכסנדר. בסוף כל מסכת מתולדות המחבר, ורשימת הספרים המביאים מדבריו. (רשימה מפורטת בהקדמת שו"ת שאילת שלום, תשל"ג, יב; טל אורות, ח"א, קנח). המו"ל קיוה להדפיס גם ח"ב על ב"ק בכורות וערכין. בקולופון התנצל על שאינו מדפיס את כל גומפלי.
המכתבים שקיבל, ומניחם לח"ב. היה ברשותו קונ' "אלה תולדות", מכתבים מרבנים על המחבר, ובמיוחד מרצ"י מיכלזון.
ילדי ר' פנחס: א. הינדה זו' ר' מאיר וואהל מבריסק דליטא ב"ר שאול השר; ב. ר' ישראל איסרל. נפטר בקראקא ביום כ"ד סיון שפ"ג; ג. ר' שמואל (שמלקא). נפטר שם ביום ג' י"ג תמוז שפ"ב. הדפיס מחדש ד"ח שו"ע עם הגהות דודו הרמ"א בשנים שע"ו-שע"ט. (פרידברג השתבש מאד בכל פרק זה.
הוא מונהו כאבי הבנים: 1. ר' יהושע ארוך; 2. ר' יהודה אבי: א. ר' דוד אב"ד טארלא, צוזמיר וסלאנמי, אבי ר' משה רב בלבוב, אבי ר' דוד, אבי רצ"ה רב בברודי סביב תקל"ג; ב. ר' בנימין זאב וולף סירקיש דומ"ץ קראקא ואב"ד ווידיסלב; 3. ר' יצחק חתן ר' משה נייגאס. נפטר בפרג ביום ה' כ' תשרי תכ"ז); ד. ר' יהודה מוינא. נפטר שם ביום ב' י"ג אב ש"ץ; ה. ר' יצחק בקראקא. נשא את יוטא בת ר' אליעזר ליפמן מורבטשיק שנפטר שם ביום כ"ו כסלו שנ"א. ירש את כס חמיו ואביו כפו"מ ונאמן וד"א. נפטר בוינא ביום י"ז שבט שצ"א. ילדיו: 1. ר' אליעזר (או יום טוב) ליפמן. נשא את אסתר בת ר' אברהם אברשקי וואהל, ב"ר מאיר בן השר. ממנה נולדו לו: א. ראי"ל מבוצץ ראש מדינה בלבוב, אבי ר' זכריה מנדל מפודהייץ ופפד"א; ב. שפרה זו' ר' בריש אב"ד פפד"א, בנו של הפנ"י ואביו של רצ"ה רוזניש אב"ד לבוב. (פרידברג מונה כמס' 1 את ר' אשר זליג חתן ר' הירש שור); 2. ר' משולם זלמן דומ"ץ קראקא; ו. ר' יהושע ארוך מפרמיסלא (להלן), ויותר נכון ר' יעקב אביו; ז. זו' ר' מאיר מענזילס. (פרידברג מונה גם: ח. ר' דוד דומ"ץ וינא, חתן ר' יצחק שפירא, נפטר שפ"ה לערך, וזו' טריינדל שם ביום כ"ט סיון ש"ץ. ילדיו: 1. ר' שמשון, נפטר י"ח תשרי שצ"א; 2. ר' אשר זליג, נפטר י"ח סיון שצ"ט; 3. ר' משה ר"מ בלבוב, נפטר שם ביום ל' אב ת'; ט. רבקה שטרן זו' הרב משה אהרן תאומים, והנכון שהיתה אחותו בת אביהם ר' ישראל).
את ר' פנחס מחליפים רבים (ובתוכם ראז"מ) עם כפילו ר' פנחס הורביץ תלמיד הסמ"ע. מחכמי פרג, אב"ד פולדא, ואח"כ שוב דומ"ץ הגבוהים בפרג. גר בביתו של ר' אהרן משולם זלמן דלעיל, והיה כנראה נכדו. נפטר שם ישיש ביום ב' י"ג חשון תי"ד. נערץ בדורו עד מאד. פרשת גדלו ושבחיו בשו"ת חות יאיר, קכד, הכותב שהיה בקי בכל ש"ס ופוסקים בע"פ, וספדו לו ל' יום כמו על מרע"ה. פסק מתוך הראש"ש, וחלק על הרמ"א. נשא את ליפט (או לופט) בת ר' בצלאל חריף ר"מ בקעלן, בנו יחידו של המהר"ל. בזיווש נשא את שינדל בת ר' אברהם גומפלש מפרג, אם בניו ובנותיו. נפטרה שם ביום א' כ"ט סיון תט"ו. ילדיו: א. ר' דוד. רב בכמה קהילות במעהרין. נפטר בפרג ביום ד' י"ג שבט תכ"א. בנו ר' אהרן דומ"ץ עלקוש, נפטר בפרג בטבת תס"ג; ב. ר' ישעיה. נפטר על פני אביו ביום ט' טבת ת'; ג. שרה זו ר' מאיר מענצלין אוירבך מוינא. נפטרה שם בשבת י"א אדר תי"ז; ד. יוטל זו ר' שמואל עזריאל מפרג. נפטרה שם בניסן ת"א.